Thèse : influence de l'augmentation de la salinité sur les huîtres d'élevage de la lagune de Thau et leurs ressources trophiques - Sète, Occitanie, FR - IFREMER

Description de l'offre

Poste à pourvoir: Thèse : influence de l'augmentation de la salinité sur les huîtres d'élevage de la lagune de Thau et leurs ressources trophiques dans un contexte de réchauffement climatique et d’acidification (H/F)

Référence du poste : PV-2024-1460

Structure d'accueil : Département Oceanographie et Dynamique des Ecosystemes

Unité Littoral

Laboratoire Environnement Ressources Languedoc Roussillon

Localisation :  Sète, Occitanie, FR

Durée en mois : 36

Date de clôture de réception de candidatures : 12/05/2024

Description de l'offre:

Cette thèse de Doctorat sera réalisée au sein de l’Ifremer et de MARBEC en partenariat avec le LEMAR, le LOV, IHPE et le MPO Ministère des Pêches et Océans Canada. L’encadrement sera réalisé par des spécialistes des interactions conchyliculture/environnement et plus particulièrement de l'huître creuse (Dr Marion Richard), du phytoplancton (Dr Béatrice Bec) et de la modélisation d’écosystème lagunaire (Dr Annie Fiandrino). La thèse fait suite aux expérimentations réalisées en mésocosmes dans le cadre du projet « COCORICO2 » en collaboration avec le Comité Régional de la Conchyliculture en Méditerranée (CRCM). Elle intégrera le projet MITIC (2024-2027), porté par Dr Fabrice Pernet, en collaboration avec Dr Frédéric Gazeau.

Les lagunes méditerranéennes sont menacées par le réchauffement climatique et l’acidification couplés à des phénomènes d’augmentation de la salinité. Dans ces conditions, se pose la question de la durabilité des services écosystémiques à long terme. C’est le cas de la lagune de Thau, exploitée par la conchyliculture, où la salinité ne cesse d’augmenter et atteint des valeurs de 42,9 en été. Jusqu’à quel seuil de salinité, couplée à de fortes chaleurs, les huîtres creuses, leur microbiote et leurs ressources trophiques survivront elles ? Sera-t-il toujours possible de produire de l’huitre creuse dans la lagune en 2050 ?

L’objectif de cette thèse est de répondre à ces questions en se focalisant sur l’impact du réchauffement climatique, de l’acidification et des fortes salinités sur la survie, la croissance, le métabolisme, le microbiote de l’huitre et sur deux espèces phytoplanctoniques (Chaetoceros, Skeletonema) correspondant à leur ressource trophique. Elle couple des approches en laboratoire, en mésocosme et en modélisation pour mieux comprendre et prédire les modifications engendrées par le changement global sur la durabilité des cultures marines dans la lagune de Thau.

Elle s’inscrit dans le cadre du contrat d’objectifs de moyens et de performances de l’Ifremer, aux ambitions 2 & 5 de MARBEC et permettra de répondre en partie aux inquiétudes de l’Etat et de la profession pour une meilleure gestion de la filière conchylicole dans ce contexte de changement global. Finalement, elle sera valorisée au niveau international par une conférence et des publications de rang A.

Changement climatique, acidification, salinité, Crassostrea gigas, Chaetoceros, Skeletonema, mésocosmes, observation, modélisation

Profil recherché

Etudiant(e) de M2 motivé(e) pour effectuer un doctorat sur la problématique proposée. Bonnes connaissances en écologie marine, sur les huîtres, le phytoplancton et leur microbiote et motivé(e) à l’idée de réaliser des expériences en mésocosmes et en laboratoire. Enthousiaste par les approches métabarcoding et la modélisation. Dossier universitaire solide. Faculté de traitements de données et d’analyses statistiques. Faculté à rédiger et à communiquer en anglais. Rigoureux(se), consciencieux(se), autonome, aimant travailler en équipe, mobile et disponible de 2024-2027.

Conditions de travail

Véritable opportunité de travailler sur les thématiques prioritaires de l’Ifremer, les contrats doctoraux proposés par l’Ifremer ouvrent droit, pour une durée de 3 ans, à une rémunération forfaitaire mensuelle brute égale à 2300 euros brut, non cumulable avec d’autres bourses d’étude.

Modalités spécifiques à la thèse :

• Accueil principal à la station Ifremer de Sète au sein du LERLR et de l’UMR MARBEC
• Déplacements hebdomadaires sur Mèze pour les expérimentations en mésocosmes et possibles astreintes (2025-2026)
• Embarquements sur la lagune de Thau pour prélèvements
• Déplacements réguliers sur Montpellier et Palavas (sites MARBEC) pour les expérimentations sur le phytoplancton et analyses associées
• Mission programmée sur Plouzané (LEMAR) en 2025 pour les expérimentations sur les huîtres et analyses associées
• Mobilité prévue au Canada (Nouveau Brunswick) en 2026 pour le volet Modélisation

Le dossier de candidature doit comprendre :

• un CV
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes (Licence + Master 1 et premier semestre Master 2)

L’ensemble des documents doit être déposé sur ce site sous la forme de 2 documents.PDF. Chaque document pouvant aller jusqu'à 3 MB.

La date limite pour la remise des candidatures est le 12 mai 2024. Néanmoins, nous vous engageons fortement à faire part dès que possible de votre intention de postuler, en écrivant aux trois encadrantes de la thèse : annie.fiandrino@ifremer.fr,  marion.richard@ifremer.fr et beatrice.bec@umontpellier.fr

Les contrats des doctorants démarreront à compter du 1er octobre 2024, sous réserve de la production par le doctorant des documents administratifs autorisant son recrutement par l’Ifremer (attestation de réussite au master 2 ou diplôme d’ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors U.E.).

L’Ifremer

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.

Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. L'institut est placé sous la tutelle du ministre chargé de la recherche, du ministre chargé de la mer et du ministre chargé de l'environnement.

Pour postuler

Date de clôture de réception de candidatures : 12/05/2024

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.