Ce site utilise des cookies. Pour en savoir plus sur notre politique d'utilisation des cookies, cliquez Politique d'utilisation des cookies

VSC Ingénieur bioinformatique (H/F) - Tahiti - IFREMER

Publiée le: 10/29/2018

Résumé de l'offre

Description de l'offre

Poste à pourvoir: VSC Ingénieur bioinformatique (H/F)

Référence du poste : PV-2018-588

Structure d'accueil : Département des Ressources Biologiques et Environnement

Unité de recherche Ressources Marines en Polynésie Française

Localisation :  Vaira'o, Windward Islands, PF

Durée du contrat :

 

Date de clôture de réception de candidatures : 30/11/2018

 

 

 

Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer, l’Ifremer contribue, par ses travaux et expertises, à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes. L’Ifremer est source de connaissances, d’innovation, de données de surveillance et d’expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d’activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe.

 

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation, et du ministère de la Transition écologique et solidaire.

 

Description de l'offre:

Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer, l’Ifremer contribue, par ses travaux et expertises, à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes. L’Ifremer est source de connaissances, d’innovation, de données de surveillance et d’expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d’activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe des ministères de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de l'Environnement, de l'Énergie et de la Mer.

L’unité de recherche Ifremer « Ressources Marines en Polynésie française » (RMPF) au sein du département RBE est intégrée dans l’UMR « Ecosystèmes Insulaires Océaniens » (EIO). RMPF est une unité travaillant en écophysiologie et disposant de l’ensemble des ressources permettant le développement de projets intégrés depuis l’échelle moléculaire jusqu’aux populations étudiées en interaction avec l’environnement récifo-lagonaire. Ainsi RMPF dispose en particulier d’infrastructures expérimentales modulaires ainsi que de laboratoires équipés en biologie moléculaire/microbiologie/histologie.

Au sein de l'unité de recherche Ressource Marines en Polynésie Française, il/ elle vient renforcer l'activité des chercheurs de l'Ifremer Tahiti en matière d'analyse de données issues des technologies NGS, générées dans le cadre des recherches en soutien aux filières perlicole (huître perlière Pinctada margaritifera) et aquacole (poisson lagonaire, Platax orbicularis). Ces travaux s’inscrivent dans des projets financés principalement par les conventions avec la Direction des Ressources Marines et Minières (2019-2021) de la Polynésie française.

Les missions sont les suivantes :

  • procéder à l'analyse des données NGS résultant et à la définition des plans d’échantillonnage et expérimentaux (terrain et laboratoire) pour les générer
  • réaliser une veille scientifique et bibliographique sur les technologies NGS et les algorithmes d’analyses de données RAD-Seq, RNA-seq, WGS/WGBS et métabarcoding et metatranscriptomiques
  • participer au développement d’une base de données des ressources génomiques de P. margaritifera en lien avec la cellule bioinformatique Ifremer (Best)
  • communiquer avec la cellule bioinformatique pour l’installation et le test de programmes d’analyses
  • former les nouveaux arrivants, étudiant en formations (doctorant, master 2, L2-L3) à l’utilisation du cluster et de certains logiciels
 

 

Profil recherché

Niveau bac+5: Ingénieur/ Master II

  • Bioinformatique
  • Statistiques appliquées à la génomique
  • Maîtrise de R, Python, Linux (bash)
  • Aptitude à la rédaction (rapports et articles scientifiques)
  • Sens de l’organisation, rigueur, esprit d’initiative
  • Aptitude à communiquer et travailler en équipe
  • Maîtrise de l'anglais scientifique
  • Permis B souhaité

Une expérience de laboratoire est souhaitée.

 

 

  • Temps complet : 100%
  • Le statut du volontariat de service civique est régi par la réglementation relative au service civique.
  • Poste de VSC d’une durée de 12 mois, éventuellement renouvelable 12 mois
  • Montant de l'indemnité : 2070 euros bruts mensuels (exonérée de l'impôt sur le revenu

 

 

 

Pour postuler

Date de clôture de réception de candidatures : 28/11/2018

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.