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CDD Ingénieur en microbiologie (H/F) - La Tremblade - IFREMER

Publiée le: 6/1/2018

Résumé de l'offre

Description de l'offre

Poste à pourvoir: CDD Ingénieur en microbiologie (H/F)

Référence du poste : PV-2018-549

Structure d'accueil : Département des Ressources Biologiques et Environnement

Unité de recherche Santé Génétique et Microbiologie des Mollusques

Laboratoire Génétique et Pathologique des Mollusques Marins

Localisation :  La Tremblade, Nouvelle-Aquitaine, FR

Durée du contrat : 4 mois

 

Date de clôture de réception de candidatures : 21/06/2018

 

 

 

Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer, l’Ifremer contribue, par ses travaux et expertises, à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes. L’Ifremer est source de connaissances, d’innovation, de données de surveillance et d’expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d’activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe.

 

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation, et du ministère de la Transition écologique et solidaire.

 

Description de l'offre:

Au sein de l’unité SG2M (Santé Génétique Microbiologie des Mollusques), le Laboratoire de Génétique et Pathologie des Mollusques Marins (LGPMM), localisé à La Tremblade, centre ses objectifs sur la valorisation des compétences et l'acquisition de connaissances dans le domaine de la robustesse et de la santé des espèces d'intérêt en aquaculture marine avec une spécificité marquée pour les mollusques bivalves, les interactions avec les agents pathogènes associés, et les bases génétiques des réponses mises en place par les protagonistes évoluant dans un milieu ouvert et changeant.

Le LGPMM est un lieu d’intégration forte entre des activités de recherche et de surveillance/référence grâce une expertise reconnue internationalement. Il est Laboratoire National de Référence (LNR) pour les maladies des mollusques, et Laboratoire de Référence de l’Union Européenne (LRUE) pour les maladies des mollusques marins, laboratoire OIE de référence vis-à-vis de la bonamiose et de la marteiliose, et assure la coordination de la surveillance nationale au travers du réseau de surveillance Repamo (Réseau de Pathologie des Mollusques).

Le poste à pourvoir sera positionné au sein de l’équipe du Laboratoire National de Référence, sous l’autorité du responsable du LGPMM. Il/Elle travaillera en concertation avec le coordonnateur du LNR dans l’optique de développer et diffuser au réseau de laboratoires agréés une base de données MALDI-TOF spécifiques des bactéries pathogènes des mollusques marins.

Mission principale :

Le-la candidat-e aura pour mission la réalisation d’une base de profils spécifiques de Vibrio d’intérêt pour les mollusques marins via l’outil Maldi-Tof.

Activités principales :

Il/Elle devra :

- Analyser les spectres bruts obtenus par Maldi-Tof et créer des spectres de référence

- Construire une base de données répertoriant l’ensemble des spectres de référence obtenus

- Compléter l'identification des espèces bactériennes par séquençage si besoin

- Participer à la valorisation des travaux (publications, communications)

 

 

Profil recherché

Formation : Master II ou diplôme ingénieur ou Doctorat dans les domaines de la microbiologie générale et biologie moléculaire.

Expérience professionnelle souhaitée dans la création de spectres de référence via l'outil Maldi-Tof

  • Compétences techniques / métiers (savoirs, savoirs faire) :
  • Maitriser les logiciels Flex Analysis et MBT compass pour l’analyse des spectres obtenus par Maldi-Tof
  • Savoir créer des spectres de référence pour l’outil Maldi-Tof
  • Biologie moléculaire avec une expérience en analyse de séquences

 

  • Qualités personnelles (savoir-être) :
  • Autonomie
  • Rigueur
  • Facilité de communication
  • Aptitude à travailler en équipe
 

 

CDD de 4 mois à temps plein

03/09/18 au 31/12/18

 

 

 

Pour postuler

Date de clôture de réception de candidatures : 21/06/2018

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.