Technicien microbiologie moléculaire (H/F) - Roscoff, Bretagne, FR - IFREMER

Publiée le: 7/27/2020

Résumé de l'offre

Description de l'offre

Poste à pourvoir: Technicien microbiologie moléculaire (H/F)

Référence du poste : PV-2020-078

Structure d'accueil :  Département des Ressources Biologiques et Environnement

Unité de recherche Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins

Localisation :  Roscoff, Bretagne, FR

 

Date de clôture de réception de candidatures : 30/09/2020

 

 

 

 

L’Ifremer

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.

Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. Il est placé sous la tutelle conjointe des ministères de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation (MESRI), de la Transition écologique et solidaire (MTES), de l’Agriculture et de l’Alimentation (MAA).

 

Description de l'offre :

La SBR constitue un environnement scientifique et logistique idéal au développement du projet de l’équipe Génomique des Vibrios de par la présence des différentes plateformes technologiques auxquelles l’équipe a recours (bioinformatique, imagerie, cristallographie, service mer) et les projets de recherche fondamentaux développés dans les unités (écologie, biologie de microorganismes marins). Réciproquement l’équipe enracine ses questions scientifiques et ses modèles expérimentaux dans les besoins de recherche appliquée que l’Ifremer doit mener (bactéries pathogènes d’huîtres).

Le poste s’intègre dans l’équipe du projet ERC advanced DYNAMIC qui vise à comprendre le rôle des phages dans la dynamique éco-évolutive de vibrios pathogènes d’huîtres creuses.

Sous la supervision de la responsable scientifique du projet, il/elle travaillera en étroite collaboration avec un post doctorant pour effectuer des expériences au laboratoire.



Missions principales 

Il/elle effectuera des expériences au laboratoire, sera en charge de la traçabilité des collections et du suivi d’une partie des commandes de consommables. Un effort particulier sera demandé à la rédaction du cahier de laboratoire et des souchiers communs. Il/elle participera aux réunions d’équipes ainsi qu’aux séminaires de laboratoire.



Activités principales

  • Il/elle sera en charge de l’isolement, culture et stockage d’une collection de vibrios et de phages ainsi de sa traçabilité sous forme de fichier excell. Il/elle effectuera une grande série d’infections croisées pour déterminer le spectre d’hôte des phages.
  • Il/elle réalisera des extractions d’ADNs pour séquençage génomique de ces phages et vibrios. Il/elle effectuera des infections expérimentales d’huîtres avec des vibrios en présence ou absence de phages, ainsi que des expériences de compétition in vitro.
  • Il/elle réalisera des études de dynamique d’infection par des phages dans différentes conditions in vitro (dosage en dilution limite, qPCR, FISH PHAGE).
  • Il/elle réalisera des clonages au vue de mutagéniser des vibrios ou de surexprimer des protéines chez E. coli.

Il/elle bénéficiera de formations complémentaires au laboratoire ou à la station sur des techniques plus spécialisées (génétique des vibrios et des phages.

 

 



Champs relationnel

 

  • En interne : Equipe du projet, (8 personnes), de l’unité LBI2M à Roscoff (100 personnes) et de la station (350 personnes) diverses réunions et séminaires favoriseront les interactions. Des échanges réguliers auront lieu avec les personnels de l’unité PFOM – centre Ifremer Bretagne – sites Plouzané/Argenton.

 

  • En externe (hors Ifremer et hors SBR) : CNRS, Institut Pasteur et Ecole Polytechnique de Lausanne.
 

 

Profil recherché



Profil

IUT, licence professionnelle en microbiologie

 



Compétences mises en œuvre 

Compétences techniques / métiers

  • Isolement et culture de microorganismes (à minima bactérie, un plus si phage) - Biologie moléculaire, qPCR, clonage, séquençage

 

Qualités personnelles

  • Rigueur et organisation pour un travail produisant un grand jeu de données, soin apporté à la traçabilité
  • Désir d’apprendre de nouvelles techniques, curiosité et adaptabilité
  • Capacité à travailler en équipe et à communiquer
 

 



Conditions de travail

La mission concerne essentiellement un travail au laboratoire. Il/elle pourra cependant participer à quelques missions de prélèvement sur le terrain (fermes ostréicoles).

Toutes nos candidatures sont traitées via notre site carrière. Pour plus de renseignements sur le poste, envoyez votre mail à Frederique.Le.Roux@ifremer.fr, responsable scientifique du projet ERC advanced DYNAMIC.

 

 

 

 

Pour postuler

Date de clôture de réception de candidatures : 30/09/2020

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.