Alternant Ingénieur Bioinformatique (H/F) - Nantes, Pays de la Loire, FR - IFREMER

Publiée le: 4/6/2021

Résumé de l'offre

Description de l'offre

Poste à pourvoir: Alternant Ingénieur Bioinformatique (H/F)

Référence du poste : PV-2021-933

Structure d'accueil : Département des Ressources Biologiques et Environnement

Unité de recherche Ecologie et Modèles pour l’Halieutique

Localisation :  Nantes, Pays de la Loire, FR

Durée du contrat : 1 an

 

Date de clôture de réception de candidatures : 27/04/2021

 

 

L’Ifremer

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.

Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. Il est placé sous la tutelle conjointe des ministères de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation (MESRI), de la Transition écologique et solidaire (MTES), de l’Agriculture et de l’Alimentation (MAA).

 

Description de l'offre:

L’unité EMH acquiert des connaissances et développe des méthodes pour l’approche écosystémique des pêches, en particulier pour l'évaluation intégrée des écosystèmes. Son projet de recherche comporte 3 axes thématiques : Mécanismes et réponses des composantes de l’écosystème aux pressions, Évaluation intégrée de l’état des écosystèmes et Evaluation de stratégies de gestion intégrée. S’y ajoute un quatrième axe regroupant les activités liées au Système d’information halieutique (SIH), l’expertise et la qualité.

Activités principales

Au sein de l’unité Écologie et Modèles pour l’Halieutique, l’alternant (e) aura pour mission de soutenir la réalisation de projet de recherche. A ce titre il devra

  • maintenir à jour une base de données de référence mitochondriale.
  • gérer des données de séquençage issue de metabarcoding d’échantillon d’eau de mer (eDNA) ou de contenus stomacaux de poissons.
  • appliquer de pipeline de traitement des données eDNA en partenariat avec la cellule bio informatique IFREMER (SebiMER)
  • développer des amorces spécifiques de poissons d’intérêt
 

 

Profil recherché

Etudiant (e) en Master 2 en bioinformatique, analyse de données génétiques (metabarcoding) ou similaire, vos qualités sont:

Savoirs, savoirs faire

  • Langage de programmation R, phyton, bash…
  • Compétence en écologie trophique/phylogénie
  • Connaissance/expérience en bancarisation et analyse de données génétiques

Savoir-être

  • Rigueur, autonomie, curiosité
  • Esprit de synthèse, intégration de connaissances
  • Capacités de rédaction en anglais, clarté de communication en français et en anglais
 

 

Conditions de travail

  • Contrat d’apprentissage ou de pro d’une durée de 1 à 2 ans à définir en fonction des modalités de l’alternance proposées par l’école.

 

 

 

 

Pour postuler

Date de clôture de réception de candidatures : 06/05/2021

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.