Alternance - Techninien en biologie moléculaire (H/F) - Brest - IFREMER

Publiée le: 5/11/2020

Résumé de l'offre

  • Type de contrat:
    Alternance
  • Lieu:
    Brest
  • Type d'offre:
  • Publiée le:
    5/11/2020

Description de l'offre

Poste à pourvoir: Alternance - Techninien en biologie moléculaire (H/F)

Référence du poste : PV-2020-795

Structure d'accueil : Département Oceanographie et Dynamique des Ecosystemes

Unité de recherche Dynamique des Ecosystèmes Côtiers

Laboratoire Ecologie Benthique Côtière

Localisation :  Brest, Bretagne, FR

Durée du contrat : 1 an

 

Date de clôture de réception de candidatures : 31/05/2020

 

 

L’Institut

Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer, l’Ifremer, a pour mission de contribuer à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes. L’Ifremer est source de connaissance, d’innovation, de données de surveillance et d’expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d’activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation.

L'Institut est structuré en quatre composantes principales :

  • une composante scientifique et technologique organisée en quatre départements ;
  • l’appui à la recherche organisé en cinq directions fonctionnelles (ressources humaines, affaires juridiques et financières, innovation, communication, affaires internationales et européennes) et en une agence comptable ;
  • une composante territoriale organisée en cinq centres (Bretagne, Méditerranée, Mer Manche du Nord, Atlantique, Pacifique) ;
  • la direction de la flotte océanographique française en charge de cette très grande infrastructure de recherche.

Aujourd’hui, l’Institut compte environ 1 500 collaborateurs.

 

Description de l'offre:

  • Présentation de la structure d’accueil

L’objectif de l’unité DYNECO (Dynamiques des Écosystèmes Côtiers) est d’évaluer la réponse des écosystèmes côtiers à un certain nombre de pressions anthropiques et naturelles. Les approches développées reposent sur l’analyse des processus physiques et biogéochimiques moteurs de l’écosystème et met en œuvre une démarche intégratrice basée sur l’expérimentation, l’observation in situ et la modélisation. Ses axes de recherche sont : i) les flux de matières dissoutes et particulaires dans les écosystèmes côtiers, ii) la diversité, le fonctionnement et le devenir des communautés et de leurs biotopes et iii) les perturbations à l’échelle des populations. Le laboratoire d’Ecologie Benthique Côtière (LEBCO) s’intéresse plus particulièrement au déterminisme de la structuration et aux fonctionnalités associées des écosystèmes benthiques côtiers de Manche-Atlantique en lien avec ces pressions. Cette développe des approches multi-disciplinaires originales, avec pour objets d’études les habitats marins et les espèces structurantes de ces habitats.

  • Introduction du poste à pourvoir et de sa position dans l'organigramme

Dans le cadre d’une formation en alternance, sous la responsabilité du responsable de l’équipe (Dr. Stanislas Dubois) et sous la direction scientifique de son tuteur (Dr. Flavia Nunes), le/la candidat(e) :

- Participera à l’acquisition de données en laboratoire (essentiellement) à travers le traitement des échantillons collectés dans les projets de l’équipe ;

- Utilisera des outils de biologie moléculaire et de génomique pour étudier la diversité génétique de modèles biologiques de l’équipe, par exemple des hermelles (vers marins) en Europe et des zostères (plantes marines) en France, ainsi que la biodiversité des invertébrés marins associées à ces deux habitats.  Les techniques de laboratoire utilisés seront l'extraction d'ADN, amplification par PCR, électrophorèse, séquençage Sanger, préparation de banques pour le genotypage par RADseq, purification et quantification des molécules.

- S’impliquera dans les activités journalières de maintenance et d’organisation du laboratoire (classement des échantillons, amélioration des procédures de laboratoire, rangement et nettoyage de la verrerie). Ce travail impliquera aussi l’utilisation des logiciels de laboratoire, le suivi et la mise à jour informatique des équipements et consommables de laboratoire.



Missions principales

Soutien technique pour l’acquisition de données génétiques pour étudier la biodiversité associée à des communautés benthiques côtières.  Les projets en cours incluent la génétique du paysage des récifs d’hermelles, diversité phylogénétique de la faune d’invertébrés associés aux hermelles et aux zostères.



Activités principales

Réalisation d’expérimentation en laboratoire de biologie moléculaire.  Extraction d’ADN de divers tissus, PCR, gel électrophorèse, purification et quantification d’ADN par spectrométrie.  Préparation de banques pour le génotypage par RADSeq ou de banques pour le metabarcoding eukaryote.  Possibilité de préparation d’échantillons sur un séquenceur Illumina NextSeq 500 (dans la Faculté de Médicine de l’Université de Brest).



Champs relationnel

  • En interne : interaction avec l’équipe PELAGOS de DYNECO, le SEBIMER (cellule Bioinfo).
  • En externe : interaction avec la Faculté de Médicine de l’Université de Brest ; Station Biologique de Roscoff
 

 

Profil recherché



Profil

  • Etudiant(e) en alternance préparant à un diplôme de technicien supérieur, au sein d’une formation dont le contenu prépare fortement aux analyses de biologie cellulaire ou moléculaire et aux techniques d’analyses génétiques en tous genres.


Compétences mises en œuvre

  Compétences techniques / métiers

  • Grand sens de l’organisation,
  • Savoir organiser un travail de laboratoire
  • Connaissances basiques en biologie et écologie et bon background en biologie cellulaire et moléculaire

  Qualités personnelles

  • Rigueur, pragmatisme et bon sens
  • Bonne humeur
  • Intérêt pour l’écologie marine (en particulier les invertébrés marins)
  • Capacité de concentration pour des taches parfois longues et fastidieuses
 

 

 

 

 

Pour postuler

Date de clôture de réception de candidatures : 31/05/2020

Toutes nos candidatures sont traitées exclusivement via notre site Carrières.